Казанский университет в годы Великой Отечественной войны был местом, где проводились самые передовые научные исследования в области физиологии.

В помещениях вуза с 1941 по 1944 год располагались эвакуированные в Казань Институт эволюционной физиологии и патологии высшей нервной деятельности им. И.П.Павлова Академии медицинских наук СССР и Физиологический институт им. И.П.Павлова Академии наук СССР, которым руководил академик Леон Орбели.

Сотрудники этих институтов занимались проблемами, связанными с лечением раненых. Они исследовали влияние на организм недостаточного снабжения кислородом, взрывной волны, стимуляторов центральной нервной системы и многое другое.

Ученые-физиологи не только занимались научной работой, но и оказали существенное влияние на лечение раненых в госпиталях эвакопунктов. Л.Орбели оперировал раненых, читал лекции врачам госпиталей эвакопунктов о физиологических основах травматического шока. В 1942 года им были сделаны доклады: «Развитие биологических наук в СССР за 25 лет», «Учение И.П. Павлова и война», «Эволюционный принцип в применении к физиологии центральной нервной системы».

В целях повышения квалификации врачей военных госпиталей в декабре 1942 года ведущие отечественные физиологи читали лекции в Бюро научной пропаганды: «Дыхательный фермент – угольная ангидраза и его значение в диагностике сепсиса» (Е.Крепс), «К вопросу о взаимоотношениях между ощущениями и условным рефлексом» (Г.Гершуни), «Физиологические механизмы контрактур» (А.Гинецинский), «Роль гормонов, ферментов и витаминов при боевых повреждениях» (Е.Крепс), «Добавочные средства белкового питания» (Г.Васильев), «Регуляция углеводного обмена при повреждениях нервной и эндокринной систем»(Л.Лейбсон).

Стремление ученых улучшить обеспечение фронта и тыла продовольствием проявилось в работе специальной комиссии во главе с академиком Л.Орбели, которая начала свою деятельность в апреле 1942 года в Казани. Перед ней была поставлена задача выявления дополнительных пищевых ресурсов. В состав комиссии входили две подкомиссии – ботаническая и зоологическая. Опираясь на изыскания ученых Ботанического института АН СССР и исследовательских учреждений Поволжья, было организовано изучение растительных ресурсов региона, поиски новых видов пищевого сырья. Комиссия стимулировала исследования зоологов по изучению проблемы динамики численности животных, оценки различных животных с точки зрения их значения в качестве источника пищи и сырья для промышленности.

По предложению АН СССР заведующий кафедрой физиологии человека и животных Казанского университета, профессор Н.Резвяков с сотрудниками В.Замятиной и М.Габбасовой, а также сотрудники кафедры микробиологии З.Забусова и М.Беляева проводили исследования по изысканию новых эффективных средств для ускорения заживления ран. Был изучен вопрос об эффективности лечебных свойств винил-n-бутилового эфира и его полимера в качестве наружного лечебного средства и проведены клинические испытания в Казанской ветеринарной клинике и кожной клинике Казанского медицинского института. Получены положительные результаты. В ходе исследований профессором Н.Резвяковым был рассмотрен ряд вопросов клинической медицины, связанных с применением фазного лечения, жидкого тампона из полимера, дозировки препарата в зависимости от состояния организма больного и др. Результаты исследований он доложил в мае 1942 года на научной конференции университета.

По мнению академика АН СССР Л.Орбели, полученные Н.Резвяковым результаты могли лечь в основу разработки целого ряда тем в области общей физиологии, экспериментальной патологии и клиник. Результаты этих исследований были представлены в работе «О применении винил-n-бутилового эфира и его полимера для лечебных целей в связи с общими теоретическими вопросами медицины» (1946).

На кафедре физиологии человека и животных Казанского университета в военные годы проводились фундаментальные научные исследования по изучению закономерностей возбуждения и торможения в нервно-мышечном аппарате. И.Валидов (он с 1948 г. стал заведовать кафедрой) выполнил большую серию работ по исследованию функциональных свойств мионеврального соединения при посттетаническом усилении сокращения мышц. Изучение проблемы посттетанического усиления сокращений мышцы продолжалось около десяти лет. На основании большого количества экспериментального материала И.Валидовым сделано заключение о том, что механизм посттетанического усиления сокращения мышцы связан с действием метаболитов, накапливающихся в мионевральном соединении, и ведущим фактором усиления сокращения утомленной мышцы является накопление ионов кальция. Таким образом, И.Валидовым была дана собственная оригинальная трактовка действия эндогенного кальция, освобождающегося в нервно-мышечном соединении при прохождении нервного импульса. В Казанском университете в годы войны было сформировано представление о роли кальция в мионевральном соединении, которое получило широкое распространение и развитие в настоящее время.

Сотрудники кафедры в военное время много работали на трудовом фронте: в подсобном хозяйстве, на разгрузке дров с барж и т.п. По вечерам сотрудницы кафедры шили белье для участников боевых сражений. Учебная работа в вузе в тот период велась в ограниченном объеме. Так, на кафедре физиологии училось всего 2-3 студента. 

В числе студентов кафедры был Николай Плещинский. В 1942 году он был призван в действующую армию. Воевал под Ленинградом, был рядовым разведчиком отдельного артиллерийского дивизиона. За участие в прорыве блокады Ленинграда награжден орденом Великой Отечественной войны I степени. В 1943-1945 годы он был топографом-вычислителем 945 артиллерийского полка на Брянском и 1-м и 2-м Белорусских фронтах. Участвовал во многих военных операциях: в боях за Орел (удостоен звания сержанта и медали «За отвагу»), форсировании реки Днепр (награжден орденом Красной Звезды), в битве на Курской дуге. В октябре 1945 года он был демобилизован и вернулся в университет. После окончания вуза Николай Плещинский вел в Казанском университете преподавательскую и научную деятельность, защитил кандидатскую диссертацию.