Коллектив ученых научно-исследовательской лаборатории «Структурная биология» Института фундаментальной медицины и биологии Казанского федерального университета выяснил, как можно сделать бактерию золотистого стафилококка, вызывающую множество вне- и внутрибольничных инфекционных заболеваний, безопасной для человека.

Существуют штаммы бактерий, против которых нет на сегодняшний день эффективных антистафилококковых препаратов. Молодые ученые ИФМиБ КФУ под руководством Константина Усачева занимаются поиском новых перспективных «мишеней» в клетках бактерий - компонент, при воздействии на которые можно было бы «отключать» патогенные свойства золотистого стафилококка.  

«Чаще всего мишенью для антибиотиков является аппарат синтеза белка в клетке, в частности рибосома. Одним из перспективных направлений поиска новых мишеней для разработки высокоселективных антибиотиков является регуляция процесса биосинтеза белка у патогенов путем воздействия на специфические бактериальные белки, управляющие работой рибосомы», - объяснил К.Усачев.

В результате исследований, которые были поддержаны грантом Президентской программы исследовательских проектов Российского научного фонда  для научных групп под руководством молодых ученых, сотрудники лаборатории смогли найти новую перспективную мишень для блокировки патогенных свойств у золотистого стафилококка.

«Цикл элонгации (удлинения цепи белка на один аминокислотный остаток) является самым консервативным этапом синтеза белка у всех живых организмов. При этом существуют «трудные» для синтеза рибосомой участки белков, такие как пролин-пролин (пролин – одна из двадцати аминокислот, входящих в состав белков). При этом пролин-пролиновые участки очень часто встречаются в составе белков секреторных систем, которые, в свою очередь, необходимы для выделения факторов патогенности. Для того чтобы помогать рибосоме синтезировать такие «трудные» участки, существует специальный  белок - фактор элонгации P (EF-P). При этом у некоторых организмов в структуре белка EF-P имеется специальная посттрансляционная модификация – дополнительная группа атомов, которая помогает стабилизировать тРНК внутри рибосомы. Имеется ли такая модификация у золотистого стафилококка, было не известно. Нам удалось ее обнаружить и показать, какой именно тип модификации имеется у EF-P из золотистого стафилококка, что, в свою очередь, может использоваться как мишень для нарушения работы этого белка у патогена. Мы предполагаем, что создание препаратов, нарушающих процесс модификации EF-P, позволит «отключить» патогенные свойства у золотистого стафилококка», - рассказал ученый.

Результаты работы опубликованы в журнале Федерации европейских биохимических обществ FEBS Open Bio.